نمایندگان مجلس شورای اسلامی با ۶۷ رای موافق، ۱۱۴ رای مخالف و ۳ رای ممتنوع از ۱۹۱ نماینده حاضر با کلیات لایحه بودجه سال ۹۹ کل کشور مخالفت کردند.
مسعود پزشکیان نایب رییس اول مجلس شورای اسلامی گفت: این لایحه باید به دولت برگردد و مجددا در کمیسیون بررسی شود پس به این دوره مجلس نخواهد رسید.
 مخالفان کلیات لایحه بودجه عدم انطباق با برنامه ششم، غیر واقعی بودن، عدم رعایت اصلاح ساختاری را از مهمترین ایرادات آن برشمردند.
مخالفان کلیات بودجه همچنین بودجه ۹۹ را بودجه‌ای برای شرایط عادی عنوان کردند و با انتقاد از عدم انطباق لایحه بودجه با برنامه ششم توسعه کشور، تعریف مالیات و گسترش شمول آن را موجب فشار بر قشرهای متوسط و ضعیف جامعه دانستند.