وی ادامه داد: شهید مطهری در علوم پایه حوزوی دارای مراتب بالایی از صاحب نظری و اجتهاد بود که کمتر افرادی در حوزه موفق شده اند در سن پایین به صاحب نظری و جامعیت در این علوم نائل شوند.
وی آشنایی با مکاتب فلسفی معاصر و غرب و همچنین آشنایی با جریان های فکری، سیاسی معاصر را از دیگر ویژگی های بارز شهید مطهری ذکر کرد و گفت: ایشان به فلسفه و مکاتب فلسفی برجسته غربی آشنا بود و با تکیه بر سرمایه اصیل حوزه علمیه در این زمینه به صاحب نظری رسید.
اعرافی با بیان اینکه شهید مطهری متکلم بسیار خوب و نظریه پرداز قوی بود، افزود: این شهید جریان های فکری، سیاسی معاصر را می شناخت و در مقابل هجمه های بی امان به اندیشه های اسلامی ایستادگی می کرد.
وی اضافه کرد: شهید مطهری در مقابل هجمه ها به اندیشه های اسلامی، گفتمان ساز بود و در همه قلمروها آگاهانه و شجاعانه اندیشه های اسلام را مطرح می کرد.
وی تصریح کرد: ورود به تنوع قلمروهای فکری، توجه به مخاطبان متنوع، اخلاص و معنویت، حضور در عرصه های مختلف برای دفاع از اسلام، روح انقلابی و زمان شناسی همراه با متانت و حکمت و همچنین هنر سخنوری و بیان شیوا از دیگر ویژگی های برجسته شهید مطهری است.
اعرافی بیان کرد: شهید مطهری بر این نکته باور داشت که اندیشه اسلامی ظرفیت تمدنی دارد و در دنیای جدید و تحولات پرشتاب معاصر نیز جوابگوی نیازهای انسانی است و در عصر غیبت نیز می توان به سمت پایه ریزی این تمدن حرکت کرد.
امام جمعه موقت قم در ادامه سخنان خود با اعلام مراتب همدردی حوزه علمیه با مردم و ساکنان مناطق سیل زده کشور گفت: مردم این مناطق متحمل رنج های بسیاری شده اند و مردم و گروه های مختلف تبلیغی و جهادی، ارتش و سپاه با حضور پررنگ در امدادرسانی به سیل زدگان خاطرات دفاع مقدس را زنده کردند.
اعرافی ادامه داد: حادثه سیل اخیر و حضور طلاب سراسر کشور برای کمک رسانی به مردم این مناطق جلوه ای از خدمت رسانی روحانیت به مردم و رابطه عمیق میان این ۲ را به نمایش گذاشت.
آیت الله شهید مرتضی مطهری در ۱۳ بهمن ماه ۱۲۹۸ در شهر فریمان از توابع خراسان رضوی به دنیا آمد. وی از استادان حوزه علمیه و معروفترین سخنران در دو دهه قبل از انقلاب اسلامی بود و آثار بسیاری از او بر جای مانده است.
شهید مطهری در سخنرانی ها و کتاب های خود سعی در ارائه ایدئولوژی اصیل اسلامی داشت و آثار او پس از شهادتش از اصلی ترین منابع مورد رجوع در شناسایی نظر اسلام است. این شخصیت بزرگ علمی در انقلاب اسلامی نقش موثری داشت و از سوی امام خمینی (ره) مسئول تشکیل شورای انقلاب اسلامی شد و در ۱۲ اردیبهشت ۱۳۵۸ به دست گروهک منافقین فرقان به شهادت رسید و روز شهادت او به عنوان روز معلم نامگذاری شد.