متن پیام رهبر انقلاب اسلامی به شرح زیر است:

«بسم الله الرحمن الرحیم

درگذشت استاد دانشمند جناب آقای دکتر کریم مجتهدی رحمهالله‌علیه را به جامعه‌ی دانشگاهی کشور و شاگردان فرزانه‌ی ایشان و خاندان مجتهدی تبریز تسلیت عرض می‌کنم.

دانش عمیق، نگاه انتقادی به فرهنگ غرب که خاستگاه تحصیلیِ او بود و تربیت شاگردان فراوان، از ویژگی‌های این فیلسوف غرب‌شناس بود.

مغفرت الهی را برای او مسألت می‌کنم.

سیدعلی خامنه‌ای»